蛋白质的定位与蛋白质裂解液的选择:全细胞:NP-40或RIPA 细胞质(可溶):Tris-HCl 细胞质(细胞骨架):Tris-Triton 细胞膜:NP-40或RIPA 细胞核:RIPA 线粒体:RIPA
RIPA裂解液配方
1ml RIPA buffer contains 35μl proteinase inhibitorand 10μl phosphatase inhibitor
RIPA buffer 1M Tris-HCl (pH7.5) NaCl Na-deoxycholale EDTA(pH8.0) NaF Nonidet P40 Aprotinin10μg/μl 5 ml 41 mg 1 ml 100μl 最终浓度 50mM 0.15 M (0.1%) (1%) 10μg/ml 加水到 100ml
Aprotinin 10μg/μl ;用10mM HEPES-KOH(PH8.0)溶解,备用.
Nonidet P-40简称NP-40,乙基苯基聚乙二醇,常常使用非离子性去垢剂.
Na-deoxycholale,脱氧胆酸钠,离子型去垢剂.离子型去垢剂主要作用有:裂解细胞;溶解蛋白,尤其是可以溶解一些难溶于水的蛋白,如膜蛋白等;很适合做WB,但在Co-IP
中使用,需要谨严.
亮抑霉肽(Leupeptin):抑制丝氨酸蛋白酶包含胰蛋白酶、纤溶酶、猪胰激肽原酶)和半胱氨酸蛋白酶(包含木瓜蛋白酶和组织蛋白酶B)
抑肽素A(Pepstatin A)抑制各种天门冬氨酸蛋白酶,例如组织蛋白酶D、肾素、胃蛋白酶、细菌天门冬氨酸蛋白酶和HIV蛋白酶;
胰凝乳蛋白酶抑制剂(Chymostatin)抑制具有糜蛋白酶类特异性丝氨酸蛋白酶(包含糜蛋白酶、胃促胰酶、组织蛋白酶 G)和大多数丝氨酸蛋白酶(包含组织蛋白酶B,H,L)
抗木瓜蛋白酶(Antipain)抑制木瓜蛋白酶、胰蛋白酶和纤溶酶.
氟化钠抑制酸性磷酸酶
正钒酸钠:抑制碱性磷酸酶和酪氨酸磷酸酶 (tyrosine phosphatase)
焦磷酸钠 (sodium pyrophosphate):抑制丝氨酸-苏氨酸磷酸酶(serine-threonine phosphatase) .
在与蛋白相关的检测中,首先最关键的一步即是蛋白质的提取.蛋白质的提取过程中,我们要常常加和蛋白酶抑制剂以防止蛋白质的降解.别的在磷酸化蛋白的研究过程中,磷酸酶抑制剂也是必不成少的,本文总结了常常使用的蛋白酶抑制剂PMSF,Leupeptin 亮肽素,Aprotinin抑肽酶,Pepstatin胃蛋白酶
抑制剂,EDTA-Na2等以及磷酸酶抑制剂NaF氟化钠,Na3VO4 原矾酸钠 ,BETA-glycerophosphate 甘油磷酸钠,Na2P2O4 焦磷酸钠等.对这些蛋白酶抑制剂的溶解配制,贮存液与工作液浓度,保管都做了详细的说明. 蛋白酶抑制剂 PMSF:
使用:贮存浓度:200mM,工作浓度:1mM
Leupeptin 亮肽素
特性:抑制丝氨酸和半胱氨酸蛋白酶如胰蛋白酶,木瓜蛋白酶,纤溶酶,和组织蛋白酶B
溶解性:高度溶于水(1mg/ml).4℃一周稳定,分成小份冷冻在-20℃至少6个月
使用:贮存浓度:1mg/ml,工作浓度0.5 ug/ml (1mM)
Aprotinin抑肽酶
特性:丝氨酸蛋白酶抑制剂,抑制纤维蛋白溶酶, 激肽释放酶,胰蛋白酶,糜蛋白酶的高活性.不抑制凝血酶或因子X. 溶解性:易溶于水(10mg/ml)或缓冲液(例如,tris,,pH8.0).pH约7-8的溶液在4℃可保管1周,分装保管在-20℃可至少保管6个月.防止反复冻融, pH>12.8的碱性环境可以使其灭活. 分子量:6,512
使用:贮存浓度:1mg/ml, 工作浓度:0.06–2.0 ug/ml(0.01–0.3 uM)
Pepstatin胃蛋白酶抑制剂
特性:抑制天冬氨酸(酸)蛋白酶如胃蛋白酶,肾素,组织蛋白酶D,凝乳酶, 许多微生物酸性蛋白酶
溶解性:溶于甲醇约1mg/ml; 可溶于乙醇,过夜溶解可达到1 mg/ml;在6当量乙酸中溶解度为300ug/ml.4℃稳定一周,分装储存于-20℃时可保管1个月
使用:贮存浓度:1mg/ml,使用浓度:0.7 μg/ml(1 μM) EDTA-Na2
特性:金属蛋白酶抑制剂
溶解性:溶于水至0.5M,在pH8-9的条件下,4℃
使用:工作浓度:0.2–0.5 mg/ml(0.5–1.3 mM),不需现用现配,在溶液pH值调至8-9时再加入.
磷酸酶抑制剂 NaF氟化钠 溶解性:溶于水 分子量: 41.99
使用: 贮存液:5M 工作浓度:10-20mMNa3VO4 原矾酸
钠
分子量:183.91
溶解性:溶于水,我们购买过来的是原矾酸钠.原矾酸钠需要颠末处理以后才干成为激活的矾酸钠,激活的矾酸钠才具有抑制去磷酸化的作用.原矾酸钠变成激活的矾酸钠的过程是: 100mM原矾酸钠激活储存液配制
(1).取的原矾酸钠溶解于10ml的双蒸水中,加酸调节PH至10(颜色变黄) (2).煮至无色 (3).室温冷却 (4).重调PH至10
(5)重复(1)(2)(3)(4)直至溶液坚持无色,而且PH稳定于10,分装100ul/管,每10ml裂解液加一管.(终浓度为1mM),-20度保管.
使用: 贮存液:100mM 工作浓度:1mMBETA-glycerophosphate 甘油磷酸钠 溶解性:溶于水 分子量:306.11
使用:贮存液:100mM 工作浓度:25mMNa2P2O4 焦磷酸钠 溶解性:溶于水 分子量:265.9
贮存液:100mM, 工作浓度:1-2 mM
SDS ,NP-40 ,TritonX-100这三种去垢剂的作用是分歧的,或者说作用力气强弱分歧.
SDS属于离子型去垢剂,最利害,基本可以把细胞完全破掉,DNA会释放出来,裂解液变得很粘稠.
NP-40是很温和的去垢剂,1%浓度的基本可以破坏掉胞膜,而对核膜破坏的作用弱,连系特定的buffer可以获得胞浆蛋白.
TritonX-100的才能介于NP40和SDS之间,偏向于NP40,也是常常使用的细胞裂解液成分之一,在呵护蛋白活性方面有一定作用(SDS基本会使蛋白变性失活). Brij Buffer I
Tris-HCl (1M, pH 7.5) EDTA (0.5 M) NaCl (5M) Brji 96 (10%) NP40 (10%) ddH2O to Total volume
1 millilitre (ml) millilitre (ml) 3 millilitre (ml) millilitre (ml) millilitre (ml) 100 millilitre (ml) 100 millilitre (ml)
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