法律分析：申请劳动仲裁确认劳动关系的法律依据有：《劳动合同法》第七条；《劳动法》第十六条以及《关于确立劳动关系有关事项的通知》。
一、辞工要扣钱合理吗
根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》的规定，用人单位未与劳动者签订劳动合同，但劳动者与用人单位存在事实劳动关系的，用人单位应与劳动补签劳动合同，劳动合同期限由双方协商确定。协商不一致的，任何一方均可提出终止劳动关系。用人单位提出终止劳动关系的，应根据劳动者在本单位连续工作时间，每满一年支付一个月工资的经济补偿金，不满半年的支付半个月工资的经济补偿。
二、顶替别人上班是否能确认劳动关系
顶替别人上班只是临时性的，不能确认劳动关系。用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。
三、劳动合同法和劳动法的区别
劳动法和劳动合同法区别是：1、劳动法是调整劳动关系以及与劳动关系密切相联系的其他关系的法律规范的总称；2、劳动合同法是指关于劳动合同的法律，其有广义和狭义之分。广义上的劳动合同法一般是指所有关于劳动合同的法律规范的总称。
法律依据：《劳动合同法》第七条，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。用人单位应当建立职工名册备查。
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