法律分析：快递违禁品被扣后的处理方法：
1、有保价的按照保价赔偿；
2、没有买保价的包裹将按照具体服务资费的5倍进行赔偿。
包裹不是公司物品，所以不能算职务侵占应该算盗窃。代收件人清关一些提供门到门服务的快递公司就是代收件人清关的，这些快递公司会先对货物进行报关，到时再发货的时候，会再找客户收取清关的费用；
法律依据：《中华人民共和国刑法》
第二百五十三条 【私自开拆、隐匿、毁弃邮件、电报罪;盗窃罪】邮政工作人员私自开拆或者隐匿、毁弃邮件、电报的，处二年以下有期徒刑或者拘役。
犯前款罪而窃取财物的，依照本法第二百六十四条的规定定罪从重处罚。